Esto es lo que he encontrado por internet:
Con el emule desconectado:
1.- Descargar Archivos binarios, actualmente creo que es v0.47c
2.- Busca donde tienes instalado tu emule antiguo C:Archivos de programaeMule (por defecto).
3.- Abre el archivo zip que te has descargado antes y vete reemplazándolos ficheros en las carpetas correctas:
* config
* lang
* webserver
* emule.exe
* Template.eMuleSkin.ini
4.- Inicia eMule y cancela el asistente de nueva configuracion.
5.- Cambia todos los accesos directos al programa y ya tendrás la última versión del eMule con tu configuración personalizada.

Profesor de Educación Especial con alumnado con autismo. Educación y Tecnologías. http://about.me/aitor.lopez
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